一、
身分確認：
遇有無名屍體或路倒病患不知身分時，甚至重大災難事件之罹難者身分等，可以指紋比對確認身分。
二、
可防止冒名頂替：
遇有身分不明或冒名頂替時，亦可用指紋比對防止冒名頂替。
三、
犯罪偵查：
從刑案現場採得之現場指紋，可以比對出犯罪嫌疑人之指紋，證明嫌犯到過現場，進而協助犯罪偵查。並運用於協助現場重建，指紋鑑識結果更是法院偵審的重要證據。
四、
代替印鑑：
重要契約或文件上以指紋取代印鑑，可免於被偽造、變造。
五、
出入境或移民的管制：
為防止恐怖分子或危險分子入境本國，可以指紋辨識，將其阻擋其於境外。
